4.政府角色的不同
苏南模式在苏南发展之初，政府的作用非常强大，以至于有学者把苏南模式称为“政府超强干预模式”，这种政府主导是在当时国家计划经济背景下进行的，苏南模式的超强干预表现在从微观的角度进行干预，甚至指派责任人推进乡镇企业的发展，有明显的政企不分的特征，政府角色既是裁判员也是运动员。
东莞模式下，经济发展也是由地方政府主导，但是他的作用是起引导作用，通过各种优惠政策推动企业发展。主要是对资源进行引导，比如组织和主导土地资源、劳动力资源和侨商资源，通过整合和引导，促进企业取得巨大发展。佛山模式下的政府的干预就更少了，充分发挥市场无形的手的作用。
5.经济结构比重不同
苏南地区的国有企业和集体企业的比重较多，而东莞和佛山地区的国有和集体企业的比重较少，东莞主要以外资企业为主，佛山则几乎一直以发展本地民营企业为主。
经过了40年的发展，苏南地区以苏州为代表的民营经济为苏州全市生产总值贡献了近一半的份额；改革开放初期东莞的经济以国有经济为主，后来民营企业才出现，经历了从无到有、从有到优、势如破竹般的发展态势，到了2017年东莞民营经济已占全市生产总值的半壁江山，经济完成增加值3739.48亿元，对全市经济增长的贡献率为54.2%，其GDP比重逐年攀升，从2011年37.5%提高到2017年49.3%。佛山历来重视发展民营企业，在2018年，民营企业达23.1万户，比重近90%。