就在国务会议举行的前一天,应两广巡阅使陆荣廷的邀请,孙中山偕章太炎、朱执信、廖仲恺、陈炯明等率海琛舰、应瑞舰自上海出发,经虎门抵达广州,孙中山在广东各界的欢迎会上发表演说,号召护法。21日,海军总长程璧光和第一舰队司令林葆怿响应孙中山的护法号召,以联名通电提出拥护《约法》、恢复国会、惩办祸首三项主张,随后率第一舰队的十艘军舰南下,护法运动自此开始。
8月1日,冯国璋抵达北京,他先行前往东厂胡同会晤前总统黎元洪,随后宣布继任大总统。就职以后,任命张一麐为秘书长,师景云为侍从武官兼军事办公处长,熊炳琦为侍从武官兼参谋长,张宗昌为侍从武官兼副官处长,殷鸿寿为侍从武官兼执法处长,侍从武官长仍为廕昌,总统府指挥使仍为徐邦杰,随后又与北洋巨头王士珍、段祺瑞见面,冯国璋在见面时力陈要互相团结、重振北洋,但当时的“北洋三杰”各怀心事,早已经是形同陌路。王士珍因为是复辟的附从,早已是心灰意懒,而冯国璋和段祺瑞则是各怀心事。
在临时参议院组建完成、总统也到任以后,段祺瑞就着手对德宣战的事务,于4日将宣战案提交国务会议通过。对德宣战案通过之后,段祺瑞便开始和协约国各公使馆进行交涉,中国驻美国公使顾维钧报告说美国方面表示会借2亿银元给中国,资助中国出兵欧洲。但段祺瑞并不准备去欧洲打仗,他的当务之急是解决西南系的军人,因此在得到美国资助的同时,段祺瑞再次示意曹汝霖等亲日派接洽西原龟三,继续就对日借款进行商讨。让段祺瑞出乎意料的是,日方此次提出借款的条件非常宽松,几乎跟友情赠送差不多,而且日本人一改从前傲慢的脾气,笑脸相迎,段祺瑞一时还以为是在做梦。